Wśród tematów, które podejmuje zespół naukowy Ogrodu Botanicznego UW są biologia i ekologia kwitnienia, nektarowania i zapylania roślin, mutualistyczne relacje roślina – zwierzę oraz ewolucja systemów reprodukcyjnych roślin, a także badania grzybów w mrowiskach, grzyby endofityczne, grzyby episymbiotyczne, związki mrówek i grzybów. Znakomita większość tematów badawczych dotyczy gatunków roślin ginących i zagrożonych w skali kraju (np. Polemonium caeruleum§, Fritillaria meleagris), Europy (np. Ostericum palustre) czy świata (np. Orchidaceae). Tą tematyką w naszym zespole zajmują się: Małgorzata Stpiczyńska, Marcin Zych, Katarzyna Roguz, Justyna Ryniewicz. Część wątków badawczych dotyczy ochrony przyrody, od 30 lat prowadzimy badania i monitoring populacji prawie 50 gatunków roślin w północno-wschodniej Polsce (Hanna Werblan-Jakubiec, Izabella Kirpluk), zajmujemy się także roślinami siedlisk antropogenicznych Puszczy Kampinoskiej (Izabella Kirpluk).